您的位置:首页 > 技术文章 > 人肝内胆管癌细胞STR鉴定标准操作流程与结果解读指南
技术文章
一、标准操作流程
样本准备:从人肝内胆管癌细胞系中提取基因组DNA,确保样本具有代表性且细胞数量充足。DNA提取可使用商用试剂盒或传统有机溶剂法,提取后需检测DNA浓度和纯度,以满足后续检测要求。
STR位点扩增:选取人类基因组中高度多态性的13-24个STR位点,如TH01、TPOX、vWA等,使用特异性引物和PCR技术扩增这些位点。引物通常标记荧光,便于后续检测。
电泳分离与检测:将PCR扩增产物进行毛细管电泳分离,利用荧光检测系统(如ABI3500遗传分析仪)检测电泳分离后的STR片段长度,生成电泳图谱。
数据分析:根据电泳图谱分析各STR位点的等位基因(片段长度),生成细胞系的STR基因型。将获得的STR基因型与已知细胞系的STR数据库(如ATCC、DSMZ等)进行比对,确认细胞系身份或检测是否存在交叉污染。
二、结果解读指南
匹配度判定:若受检细胞STR位点的基因分型数据与其对应的标准细胞系匹配度≥80%,则判定为标准细胞系或其衍生细胞系;若匹配度在56%-80%之间,需结合细胞系形态、特异性标记物等辅助分析进行综合判断;若匹配度≤56%,则判定与其对应的标准细胞系不相关。
多等位基因分析:人源细胞STR图谱上,一个基因位点通常只出现1个或2个峰(纯合或杂合)。若出现3个及以上峰,可能提示存在同源物种交叉污染或三倍体等多倍体突变现象。
交叉污染检测:通过比对多个细胞样本的STR基因型,可检测是否存在细胞系间的交叉污染。若检测到混合样本中的不同STR基因型,则确认存在多种细胞来源。